两大测序公司争相推出HLA分型产品

　　罗氏旗下454生命科学近日宣布推出GS  Gtype  HLA引物对，用于人类白细胞抗原（HLA）基因I类和II类位点的高分辨率和中等分辨率基因分型。该引物对是为GS  Junior和GS  FLX新一代测序系统的使用而设计的，能在单次运行中实现高分辨率的分型和明确的等位基因定位。

　　HLA基因编码的蛋白识别了外源细胞及其他抗原。个体HLA型的准确鉴定对组织移植配对的研究很重要，而这些基因中的变异与多种自体免疫疾病、传染病和一些癌症相关。由于人类基因组中此区域的高度多态性，HLA基因为基因分型带来了挑战。

　　传统的分型技术是基于Sanger毛细管电泳技术，需要多次反复，才能得到明确的结果，还夹杂着繁复的数据分析，常常需要使用多种技术。然而，454测序系统独特的长读取能在一次实现多个样品的高分辨率HLA分型。在很多情况下，它能在单个测序运行中实现明确的等位基因鉴定。序列输出与第三方HLA基因分型软件工具兼容，为研究人员提供了一个从DNA到基因型的完整方案。

　　使用GS  Junior系统，从样品到完整的基因型，最快只需3天。除了节省时间，基因分型的通量也大大提高。GS  FLX系统每次运行最多能分析80个样品，GS  Junior系统最多也能分析10个样品。

　　GS  GType  HLA引物对是联合研究的成果。奥克兰儿童医院及研究中心的Elizabeth  Trachtenberg博士表示，她们已经对数千个样品进行了测序，并发现罗氏GS  FLX系统与Sanger方法相比，>99%的一致性，通量增加且含糊显著减少，并且，新方法所需的时间仅为旧方法的三分之一。

　　无独有偶，Life  Technologies近日也宣布将开展临床试验，欲证明其基于DNA序列的分型（SBT）平台在分析HLA上的安全性和有效性。在临床试验结束之后，此SBT平台将提交给FDA，申请510(k)许可。

　　Life  Technologies已经与一个临床研究机构签订了合同，以监督在美国各独立、许可的HLA分型实验室开展的临床试验。这些实验室将利用Applied  Biosystems的3500  Dx基因分析仪、SeCore®  试剂盒以及uTYPE®  Dx软件，评估HLA的六个基因区域。

　　Life  Technologies公司片段与序列基因组学分部的副总裁和总经理Todd  Laird表示：“3500  Dx系统所实现的基于序列分析以及SeCore试剂盒是目前唯一一种能够在核苷酸水平鉴定出5500个基因变异的技术，产生了更为精准和明确的分析。